MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 79021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004557	TA	5	10	13	22	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
2	NC_004557	AT	4	8	31	38	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
3	NC_004557	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
4	NC_004557	TTCC	2	8	54	61	0 %	50 %	0 %	50 %	28209835
5	NC_004557	AT	3	6	104	109	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
6	NC_004557	T	7	7	209	215	0 %	100 %	0 %	0 %	28209835
7	NC_004557	TCT	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
8	NC_004557	TCA	2	6	236	241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
9	NC_004557	ATA	2	6	245	250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
10	NC_004557	CTT	2	6	270	275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
11	NC_004557	TCTAT	2	10	305	314	20 %	60 %	0 %	20 %	28209835
12	NC_004557	CTTT	2	8	404	411	0 %	75 %	0 %	25 %	28209835
13	NC_004557	ATT	3	9	437	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
14	NC_004557	A	8	8	457	464	100 %	0 %	0 %	0 %	28209835
15	NC_004557	TCT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
16	NC_004557	TCT	2	6	580	585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
17	NC_004557	T	6	6	588	593	0 %	100 %	0 %	0 %	28209835
18	NC_004557	TCA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
19	NC_004557	AGG	2	6	631	636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28209835
20	NC_004557	AT	3	6	671	676	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
21	NC_004557	TTA	2	6	693	698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
22	NC_004557	AAT	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
23	NC_004557	T	7	7	795	801	0 %	100 %	0 %	0 %	28209835
24	NC_004557	TCT	2	6	823	828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
25	NC_004557	TAA	2	6	901	906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
26	NC_004557	CTT	2	6	915	920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
27	NC_004557	ATC	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
28	NC_004557	TCT	2	6	1005	1010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
29	NC_004557	TTC	2	6	1015	1020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
30	NC_004557	GCT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28209835
31	NC_004557	ATTTT	2	10	1100	1109	20 %	80 %	0 %	0 %	28209835
32	NC_004557	CTT	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
33	NC_004557	CTA	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
34	NC_004557	TA	3	6	1231	1236	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
35	NC_004557	CCT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209835
36	NC_004557	TAT	2	6	1317	1322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
37	NC_004557	CTC	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209835
38	NC_004557	TCT	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
39	NC_004557	TA	3	6	1405	1410	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
40	NC_004557	TTC	2	6	1420	1425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
41	NC_004557	CTC	2	6	1455	1460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209835
42	NC_004557	AT	3	6	1479	1484	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
43	NC_004557	GCA	2	6	1487	1492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209835
44	NC_004557	CTC	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209835
45	NC_004557	CTA	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
46	NC_004557	TAA	2	6	1654	1659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
47	NC_004557	AT	3	6	1660	1665	50 %	50 %	0 %	0 %	28209835
48	NC_004557	T	7	7	1694	1700	0 %	100 %	0 %	0 %	28209835
49	NC_004557	TAT	2	6	1702	1707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
50	NC_004557	ATT	2	6	1771	1776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
51	NC_004557	TCT	2	6	1783	1788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
52	NC_004557	CT	3	6	1808	1813	0 %	50 %	0 %	50 %	28209835
53	NC_004557	CTAC	2	8	1826	1833	25 %	25 %	0 %	50 %	28209835
54	NC_004557	ACA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28209835
55	NC_004557	T	7	7	1845	1851	0 %	100 %	0 %	0 %	28209835
56	NC_004557	TTTC	2	8	1961	1968	0 %	75 %	0 %	25 %	28209835
57	NC_004557	TTATCT	2	12	1991	2002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	28209835
58	NC_004557	ATC	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
59	NC_004557	ATTC	2	8	2029	2036	25 %	50 %	0 %	25 %	28209835
60	NC_004557	ATT	2	6	2044	2049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
61	NC_004557	AAAT	2	8	2062	2069	75 %	25 %	0 %	0 %	28209835
62	NC_004557	TAA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
63	NC_004557	ATT	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
64	NC_004557	TAG	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209835
65	NC_004557	TAAT	2	8	2328	2335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004557	TTA	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004557	TTA	2	6	2385	2390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004557	AATATA	2	12	2435	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004557	TTTA	2	8	2462	2469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004557	AGG	2	6	2474	2479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004557	TTC	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209836
72	NC_004557	TAA	2	6	2539	2544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
73	NC_004557	AGAA	2	8	2564	2571	75 %	0 %	25 %	0 %	28209836
74	NC_004557	A	6	6	2581	2586	100 %	0 %	0 %	0 %	28209836
75	NC_004557	TAA	3	9	2602	2610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
76	NC_004557	ACC	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28209836
77	NC_004557	T	7	7	2632	2638	0 %	100 %	0 %	0 %	28209836
78	NC_004557	TAAAT	2	10	2672	2681	60 %	40 %	0 %	0 %	28209836
79	NC_004557	GAT	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209836
80	NC_004557	AAT	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
81	NC_004557	CAT	2	6	2877	2882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209836
82	NC_004557	A	6	6	2906	2911	100 %	0 %	0 %	0 %	28209836
83	NC_004557	ATA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
84	NC_004557	A	6	6	2933	2938	100 %	0 %	0 %	0 %	28209836
85	NC_004557	ATTT	2	8	2978	2985	25 %	75 %	0 %	0 %	28209836
86	NC_004557	ATGAT	2	10	3028	3037	40 %	40 %	20 %	0 %	28209836
87	NC_004557	AAAT	2	8	3094	3101	75 %	25 %	0 %	0 %	28209836
88	NC_004557	TGG	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28209836
89	NC_004557	A	7	7	3296	3302	100 %	0 %	0 %	0 %	28209836
90	NC_004557	AAT	2	6	3306	3311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
91	NC_004557	TAA	2	6	3322	3327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
92	NC_004557	AATC	2	8	3360	3367	50 %	25 %	0 %	25 %	28209836
93	NC_004557	A	6	6	3372	3377	100 %	0 %	0 %	0 %	28209836
94	NC_004557	AGCT	2	8	3385	3392	25 %	25 %	25 %	25 %	28209836
95	NC_004557	TCA	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209836
96	NC_004557	AT	4	8	3447	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	28209836
97	NC_004557	AT	3	6	3466	3471	50 %	50 %	0 %	0 %	28209836
98	NC_004557	TTCC	2	8	3493	3500	0 %	50 %	0 %	50 %	28209836
99	NC_004557	TAT	2	6	3506	3511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209836
100	NC_004557	ATT	2	6	3681	3686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209836
101	NC_004557	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209836
102	NC_004557	AAAT	2	8	3757	3764	75 %	25 %	0 %	0 %	28209836
103	NC_004557	AT	3	6	3771	3776	50 %	50 %	0 %	0 %	28209836
104	NC_004557	GAA	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209836
105	NC_004557	AGA	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209836
106	NC_004557	T	6	6	3810	3815	0 %	100 %	0 %	0 %	28209836
107	NC_004557	AACAG	2	10	3842	3851	60 %	0 %	20 %	20 %	28209836
108	NC_004557	GTT	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28209836
109	NC_004557	TTC	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209836
110	NC_004557	AGG	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004557	TATT	2	8	3941	3948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004557	AGA	3	9	3966	3974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004557	A	8	8	3978	3985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004557	GAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004557	GGTG	2	8	4015	4022	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004557	TTTA	2	8	4056	4063	25 %	75 %	0 %	0 %	28209837
117	NC_004557	AGA	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209837
118	NC_004557	AGC	2	6	4116	4121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209837
119	NC_004557	A	6	6	4125	4130	100 %	0 %	0 %	0 %	28209837
120	NC_004557	TAAAA	2	10	4209	4218	80 %	20 %	0 %	0 %	28209837
121	NC_004557	GAA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209837
122	NC_004557	CCT	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209837
123	NC_004557	AAAT	2	8	4271	4278	75 %	25 %	0 %	0 %	28209837
124	NC_004557	A	7	7	4296	4302	100 %	0 %	0 %	0 %	28209837
125	NC_004557	ATT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209837
126	NC_004557	CTA	2	6	4379	4384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209837
127	NC_004557	AT	3	6	4433	4438	50 %	50 %	0 %	0 %	28209837
128	NC_004557	ATC	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209837
129	NC_004557	AT	3	6	4465	4470	50 %	50 %	0 %	0 %	28209837
130	NC_004557	AGA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209837
131	NC_004557	AT	3	6	4526	4531	50 %	50 %	0 %	0 %	28209837
132	NC_004557	TAAA	2	8	4542	4549	75 %	25 %	0 %	0 %	28209837
133	NC_004557	ATTA	2	8	4556	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004557	TTTA	2	8	4572	4579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004557	ATT	2	6	4583	4588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209838
136	NC_004557	TTA	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209838
137	NC_004557	TCA	2	6	4597	4602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209838
138	NC_004557	TCC	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209838
139	NC_004557	CTA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209838
140	NC_004557	TCT	2	6	4666	4671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
141	NC_004557	TTC	2	6	4695	4700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
142	NC_004557	TCT	2	6	4711	4716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
143	NC_004557	AT	3	6	4751	4756	50 %	50 %	0 %	0 %	28209838
144	NC_004557	CTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
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166	NC_004557	T	7	7	5243	5249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_004557	TGC	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_004557	TA	4	8	10703	10710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_004557	TCCT	2	8	11348	11355	0 %	50 %	0 %	50 %	28209840
281	NC_004557	TTAA	2	8	11394	11401	50 %	50 %	0 %	0 %	28209840
282	NC_004557	ATT	2	6	11408	11413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_004557	TTA	2	6	11441	11446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_004557	A	7	7	11446	11452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_004557	TTTTA	2	10	11520	11529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_004557	TA	3	6	11750	11755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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